W przypadku wykorzystania XML we własnych aplikacjach poza niezaprzeczalnymi plusami standard ten dostarcza również pewne niedogodno?ci. Należy zwrócić uwagę na fakt, że dokument XML nie jest najprostszy do przeanalizowania. Zawiera on zagnieżdżenia, atrybuty oraz reguły, które musz? być sprawdzone. W zwi?zku z tym wydajno?ć pozostawia tutaj wiele do życzenia. Oczywi?cie najbardziej to widać przy dużym dokumencie XML i przy częstym jego analizowaniu. Wydajno?ć ta jest  różna dla metody SAX i DOM (zdecydowanie na korzy?ć tej pierwszej). Drugi aspekt, to konsumowanie zasobów w przypadku metody DOM, gdzie cały dokument musi być wczytany do pamięci. Zaleca się w zwi?zku z tym zawsze przeanalizowanie, czy XML jest dla aplikacji dobrym rozwi?zaniem. Dla przykładu przesyłanie dużej ilo?ci danych pomiędzy systemami można zrealizować nie za pomoc? XML, tylko np. FTP. <br><br>